Но в вашем случае все усугубляется тем, что вы это делаете уже по факту сделанных работ. Увы, перепланировка задним числом, даже такая пустяковая, может стоить в разы дороже

По идее порядок такой - обращаетесь к архитекторам - в "Диагностик" например (на Первой речке) они тысяч за 10 сделают вам проект (правда если по готовой перепланировке - не скажу сколько запросят).
Потом надо разрешение из мэрии на проведение работ - его можно сделать самим (но не слышала, что бы это кто то занимался этим самостоятельно), и то, если вы его делаете ДО начала работ. Вот тут и загвоздка, так как по идее, без этого разрешения, вы (ну или кто сделал) не имели право начинать работы. Т.е. они придут, увидят - и речь уже пойдет о наказании - штрафах например (суммы там немаленькие).
Вот когда вы получите разрешение в мэрии - то тогда в БТИ - они сделают вам новый техпаспорт, возможно понадобится и кадастровый
После этого в ПКРЦ - регистрировать изменения